הנדסה רפואית - עוסקת יותר במכשור רפואי ובכך נבדלת ממחלקות אשר להן גם התמחויות הדורשות בסיס ביולוגי רחב, כגון: הנדסת תאים ורקמות.
תחום ההנדסה הרפואית מאוד מתפתח בעולם בכלל ובארץ בפרט, אחת הסיבות - טכנולוגיות צבאיות מתקדמות ישראליות מיושמות לטובת הרפואה. הנדסה רפואית קשורה למכשירים כמו MRI, CT, תקשורת רפואית - מהבית שולחים תשדורת למוקד, תיקים רפואיים, צ'יפים מושתלים, קפיצים בלב, לב מלאכותי, מנשמים, פרוטזות, איברים מלאכותיים, טכניקות ניתוח – לייזר במקום סכין, מכשירים קטנים כמו שעון עם לייזר למדידת רמת הסוכר באופן לא-פולשני.
גלולה עם מצלמה - רואים את כל מה שקורה במעי הגס, המצאה ישראלית עם טכנולוגיה צבאית של NASA.
למהנדס רפואי יש ידע בכל ההנדסות הקלאסיות - מכונות, תוכנה, חשמל ואלקטרוניקה וגם רפואה, טוב לסטארט-אפים הדורשים מהנדס בעל בסיס רב-תחומי.